从提示来看，是可以通过CLI方式来升级补丁。

下面以xenserver6.2升级SP1补丁为例：
1、下载XS62ESP1.zip，解压缩得到XS62ESP1.xsupdate，路径：D:\XS62ESP1\XS62ESP1.xsupdate
2、使用本地的XE程序将升级补丁上传校验，得到服务器UUID。运行CMD，
cd C:\Program files\Citrix\XenCenter
xe patch-upload -s 192.168.1.30 -u root -pw 123qwe! file-name=D:\XS62ESP1\XS62ESP1.xsupdate
得到一串数字0850b186-4d47-11e3-a720-001b2151a503
3、使用服务器UUID进行升级。
xe -s 192.168.1.30 -u root -pw 123qwe! patch-pool-apply uuid=0850b186-4d47-11e3-a720-001b2151a503
4、升级完成后自动回到命令行。关闭命令行，使用XenCenter的tools——check for updates进行检查，确认升级是否成功。
备注：命令行里面的s为XenServer的IP地址，u为root账户，pw为root对应的密码。